Table 1 List of common breakpoints

1

p34.2

41313735

41355091

58.03

SCMH1

10.4

10

q25.1

111391808

111534660

37.1

6.0

1

p34.2

41479154

41520306

21.87

11.9

10

q25.3

116921563

116965495

106.98

ATRNL1

10.4

1

p31.3

63102450

63125693

25.81

9.0

10

q25.3

117395507

117462466

37.34

ATRNL1

9.0

1

q21.1

145031426

145108225

54.69

PRKAB2

6.0

11

p13

36266146

36292214

57.54

6.0

2

p23.2

27659776

28122129

48.23

BRE

6.0

11

q23.3

117486844

117510539

84.41

SCN4B

14.9

2

p15

63302135

63367996

65.29

C2orf86

9.0

12

p13.2

11222379

11312714

55.35

PRB3

6.0

2

p11.2

88925032

88984458

53.85

6.0

12

p12.3

15020696

15041656

57.25

7.5

2

q11.2

96394039

96423431

47.63

13.4

12

p11.21

30798016

30861280

41.1

9.0

2

q14.2

118022882

119843354

27.52

DBI

7.5

12

q12

34236852

36858944

7.09

6.0

3

p24.2

25637260

25664255

25.93

TOP2B

16.4

12

q13.2

53311891

53382664

35.32

16.4

3

p24.2

25799317

25810811

8.7

OXSM

10.4

12

q13.2

54253884

54290994

40.42

13.4

3

p24.2

25810870

25997134

29.53

10.4

12

q14.1

56621139

56633663

7.98

XRCC6BP1

9.0

3

q11.2

90336752

95063426

1.23

6.0

12

q21.33

90946754

91022602

21.09

7.5

3

q26.1

163874118

163997228

33.3

47.8

13

q14.11

43044213

43114392

45.6

ENOX1

11.9

4

q23

99907678

100011201

56.99

6.0

13

q14.11

43114451

43143651

10.27

ENOX1

11.9

4

q31.3

152038958

152092912

48.19

LRBA

7.5

14

q22.1

48984150

49093570

25.59

6.0

4

q31.3

153097317

153228047

17.59

7.5

14

q31.3

88397409

88411102

51.12

TTC8

9.0

4

q34.1

174459916

174490317

23.03

HMGB2

6.0

14

q32.33

105080399

105354886

21.86

IgH

19.4

5

q13.3

75888651

75947525

25.48

IQGAP2, F2RL2

7.5

14

q32.33

105469384

105481523

57.67

IgH

11.9

14

q32.33

105787449

105834932

86.35

IgH

9.0

5

q13.3

76284777

76301015

0

CRHBP

7.5

14

q32.33

105947052

105977946

61.5

IgH

16.4

5

q31.3

140094857

140166875

59.71

PCDHA1/2/3

7.5

15

q22.2

59803190

59933103

24.63

VPS13C

6.0

5

q33.3

157216334

157301114

41.28

9.0

15

q24.3

74558533

74601045

56.45

SCAPER

9.0

5

q34

162798715

162800093

0

CCNG1

9.0

16

q11.2

34083801

45122058

2.98

FLJ43980

6.0

5

q34

162818326

162833628

19.61

HMMR

11.9

17

q12

35221880

35241893

9.99

IKZF3

11.9

5

q35.1

170161782

170195254

8.96

7.5

17

q12

35282145

35316098

55.96

GSDMB

16.4

5

q35.1

170596026

170659586

33.04

RANBP17

6.0

17

q21.2

36666037

36724675

28.99

KRTAP17-1

6.0

6

q11.1

62760108

62854732

38.05

KHDRBS2

9.0

17

q21.31

38255982

38261676

17.56

AOC3

7.5

6

q26

162822332

162896532

9.43

PARK2

7.5

17

q25.1

71511380

71527979

0

EVPL

6.0

6

q27

166369554

166405962

52.19

7.5

19

q13.12

40328372

40338038

0

FXYD5

7.5

7

p15.3

20788779

20857393

14.57

6.0

19

q13.42

61045704

61062298

66.29

NLRP4

20.9

7

p14.1

39890729

39952510

58.27

6.0

20

p13

3365914

3411271

59.53

ATRN

9.0

7

p14.1

40008069

40034702

45.06

CDC2L5

6.0

20

p13

3553255

3588125

43.02

GFRA4

9.0

7

q31.2

116015401

116093417

15.38

11.9

20

q12

40298330

40332059

0

PTPRT

22.4

7

q35

147108655

147152043

27.66

CNTNAP2

6.0

20

q13.12

43765836

43768958

0

WFDC13

6.0

8

q12.1

59427474

59488208

41.16

UBXN2B

7.5

20

q13.32

57813291

57856200

9.32

9.0

8

q12.1

59519371

59565778

15.08

CYP7A1

7.5

20

q13.33

58011342

58074892

33.04

C20orf197

7.5

8

q24.3

145297206

145464363

45.47

BOP1

13.4

21

q22.11

31050355

31088151

10.58

6.0

9

p23

11563590

11687635

54.01

6.0

22

q11.22

21520273

21588229

38.26

IgL

6.0

9

q21.33

87357577

87392381

51.72

AGTPBP1

9.0

22

q12.3

34602119

34638273

0

RBM9

6.0

10

q25.1

109269991

109444702

43.5

6.0