Amplicon | Primer sets | Primer sequence | Length* | Citation | |
---|---|---|---|---|---|
ITS | ITS1 | ITS1F/ ITS2 | CTTGGTCATTTAGAGGAAGTAA | 260 bp | |
 |  |  | GCTGCGTTCTTCATCGATGC |  |  |
 | ITS2 | 3271-ITS2F/ 3271-ITS2R | CARCAAYGGATCTCTTGG | 340-360 bp | [19] |
 |  |  | GATATGCTTAAGTTCAGCGGGT |  |  |
 | ITS1-5.8S-ITS2 | ITS1F/ ITS4 | CTTGGTCATTTAGAGGAAGTAA | 550 bp | [65] |
 |  |  | TCCTCCGCTTATTGATATGC |  |  |
LSU | LROR_F/ LR5-F | CCGCTGAACTTAAGCATATCAATA | 860 bp | [65] | |
 |  | CGATCGATTTGCACGTCAGA |  |  | |
 | NL1/ NL4 | GCATATCAATAAGCGGAGGAAAAG | 600 bp | [66] | |
 |  | GGTCCGTGTTTCAAGACGG |  |  | |
SSU | 18S_0067a_deg/NSR 399 | AAGCCATGCATGYCTAAGTATMA | 350 bp | [21] | |
 |  | TCTCAGGCTCCYTCTCCGG |  |  |