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Table 3 Effect of ICSI on the FDR 25% WBC IVF-DMRs

From: DNA methylation changes at infertility genes in newborn twins conceived by in vitro fertilisation

   

IVF (n = 40) versus non-IVF (n = 58)

IVF (n = 34) versus non-IVF (n = 58) adjusted for ICSI

Conventional IVF (n = 16) versus non-IVF (n = 58)

ICSI (n = 18) versus non-IVF (n = 58)

Chromosome

Start

End

Estimate

SE

P

Estimate

SE

P

Estimate

SE

P

Estimate

SE

P

Chr2

217726751

217727250

1.18

0.19

2.30E-09

1.45

0.26

7.71E-08

−1.42

0.26

7.44E-08

−1.16

0.27

1.29E-05

Chr5

178761751

178762250

−1.08

0.2

5.43E-08

−1.09

0.29

8.23E-05

0.87

0.30

1.89E-03

1.11

0.27

2.52E-05

Chr9

97504001

97504500

1.07

0.2

5.83E-08

0.77

0.27

2.77E-03

−0.88

0.31

2.67E-03

−1.30

0.25

1.95E-07

Chr5

9275751

9276250

1.09

0.19

5.86E-08

1.17

0.27

1.04E-05

−1.13

0.29

6.50E-05

−1.13

0.27

2.75E-05

Chr4

184814001

184814500

−0.96

0.18

7.95E-08

−0.97

0.24

3.94E-05

0.94

0.26

1.37E-04

1.15

0.23

8.35E-07

Chr5

142488501

142489000

−1.11

0.2

8.73E-08

−1.1

0.28

7.60E-05

1.25

0.31

5.16E-05

1.08

0.28

7.10E-05

Chr9

118148751

118149250

1.09

0.2

9.20E-08

1.35

0.28

1.28E-06

−1.30

0.29

8.90E-06

−1.02

0.28

1.68E-04

Chr9

118149001

118149500

1.08

0.2

1.04E-07

1.31

0.28

2.22E-06

−1.23

0.29

2.00E-05

−1.05

0.29

1.69E-04

Chr11

82654251

82654750

−1.05

0.19

1.30E-07

−0.97

0.29

4.68E-04

0.95

0.31

1.53E-03

0.88

0.27

5.94E-04

Chr19

6165251

6165750

0.94

0.18

1.40E-07

0.89

0.25

1.90E-04

−0.88

0.28

9.35E-04

−1.02

0.23

7.36E-06

Chr1

85522251

85522750

0.99

0.18

1.43E-07

1.54

0.25

4.48E-09

−1.53

0.25

7.41E-09

−0.80

0.28

2.32E-03

Chr17

42569001

42569500

−1.07

0.19

1.64E-07

−1.25

0.27

2.21E-06

1.30

0.28

3.81E-06

1.21

0.26

2.44E-06

Chr4

141606501

141607000

1.09

0.19

2.03E-07

1.26

0.26

3.56E-06

−1.33

0.30

1.05E-05

−1.13

0.26

1.83E-05

Chr5

137736001

137736500

−1.03

0.19

2.06E-07

−1.11

0.28

4.12E-05

1.13

0.30

1.39E-04

1.10

0.27

3.78E-05

Chr5

150614501

150615000

−1.08

0.21

2.14E-07

−1.2

0.29

2.80E-05

1.24

0.31

3.18E-05

1.07

0.29

1.21E-04

Chr17

36918251

36918750

−1.1

0.21

2.32E-07

−0.96

0.29

6.01E-04

1.05

0.31

4.88E-04

1.03

0.28

1.83E-04

Chr6

126138251

126138750

−0.99

0.19

2.36E-07

−0.75

0.27

3.29E-03

0.79

0.30

4.92E-03

1.22

0.25

8.94E-07

Chr7

144431251

144431750

1.02

0.19

2.70E-07

0.84

0.28

1.30E-03

−0.85

0.28

1.48E-03

−1.17

0.27

1.77E-05

Chr12

70937251

70937750

0.88

0.17

2.76E-07

0.72

0.23

1.12E-03

−0.87

0.26

5.26E-04

−0.94

0.20

3.10E-06

Chr4

141606251

141606750

1.01

0.19

2.80E-07

1.16

0.26

8.05E-06

−1.31

0.29

6.93E-06

−1.04

0.25

2.14E-05

Chr13

90019001

90019500

1.06

0.2

2.84E-07

1.25

0.29

8.88E-06

−1.36

0.30

5.09E-06

−0.84

0.29

2.20E-03

Chr11

74179001

74179500

1.07

0.2

2.92E-07

1.3

0.29

7.25E-06

−1.37

0.29

3.15E-06

−1.06

0.29

1.76E-04

Chr12

99153001

99153500

−1.01

0.2

3.93E-07

−1.02

0.29

2.02E-04

1.02

0.31

4.59E-04

1.24

0.27

3.77E-06

Chr2

223336751

223337250

−1.01

0.2

4.47E-07

−1.41

0.28

4.00E-07

1.50

0.29

1.69E-07

0.77

0.29

4.65E-03

Chr8

120972001

120972500

0.97

0.19

4.98E-07

0.83

0.27

1.22E-03

−0.87

0.29

1.43E-03

−0.96

0.26

1.81E-04

Chr17

38047001

38047500

−1.04

0.2

5.25E-07

−1.3

0.28

4.51E-06

1.31

0.27

1.21E-06

0.74

0.28

5.39E-03

Chr4

64626751

64627250

−0.99

0.19

5.45E-07

−0.87

0.28

9.92E-04

0.86

0.29

1.61E-03

0.98

0.26

1.36E-04

Chr16

87256751

87257250

−0.83

0.16

5.51E-07

−0.97

0.23

1.75E-05

0.94

0.25

9.13E-05

0.82

0.24

3.37E-04

Chr19

10656751

10657250

−1.03

0.2

5.77E-07

−1.09

0.28

6.47E-05

1.17

0.29

3.80E-05

1.13

0.27

2.18E-05

Chr7

2487251

2487750

0.8

0.16

5.85E-07

0.73

0.23

1.06E-03

−0.81

0.24

5.61E-04

−0.94

0.23

3.49E-05

Chr11

74178751

74179250

0.99

0.2

6.82E-07

1.19

0.28

2.15E-05

−1.15

0.28

2.45E-05

−0.82

0.28

2.37E-03

Chr10

119176501

119177000

−1.04

0.2

6.87E-07

−1.03

0.29

3.41E-04

1.16

0.31

1.69E-04

1.14

0.28

4.83E-05

Chr22

34755251

34755750

−0.98

0.2

7.32E-07

−0.8

0.28

2.35E-03

0.97

0.31

1.21E-03

1.15

0.25

3.95E-06

Chr6

161664751

161665250

0.98

0.19

7.42E-07

0.9

0.26

3.89E-04

−0.83

0.29

2.48E-03

−0.81

0.25

7.71E-04

Chr16

17161751

17162250

−1.01

0.2

7.80E-07

−0.99

0.28

2.19E-04

1.17

0.30

4.48E-05

1.08

0.28

1.16E-04

Chr18

23695001

23695500

1.04

0.21

8.39E-07

0.95

0.29

5.83E-04

−1.04

0.32

6.05E-04

−1.11

0.28

3.96E-05

Chr9

26364751

26365250

−0.95

0.19

8.90E-07

−0.96

0.28

2.78E-04

1.13

0.30

9.90E-05

0.96

0.28

2.77E-04

Chr1

25227001

25227500

−0.83

0.17

9.05E-07

−0.87

0.25

3.81E-04

0.78

0.25

1.39E-03

0.99

0.25

5.78E-05

Chr13

68877251

68877750

0.97

0.2

9.43E-07

1.01

0.28

1.44E-04

−1.24

0.28

1.05E-05

−0.84

0.28

1.39E-03

Chr9

89126501

89127000

−0.92

0.19

9.59E-07

−1.14

0.26

9.49E-06

1.10

0.28

6.62E-05

0.76

0.26

2.12E-03

Chr13

35317501

35318000

−0.96

0.2

9.72E-07

−0.54

0.29

4.44E-02

0.54

0.31

6.52E-02

1.04

0.27

7.61E-05

Chr21

19575001

19575500

0.96

0.19

9.92E-07

0.88

0.27

8.63E-04

−0.96

0.30

8.25E-04

−1.13

0.26

1.24E-05

Chr2

169470001

169470500

−1.02

0.21

1.06E-06

−1.31

0.28

2.08E-06

1.33

0.29

6.99E-06

1.04

0.27

5.91E-05

Chr12

4310251

4310750

−0.99

0.2

1.06E-06

−0.91

0.29

8.79E-04

1.02

0.30

4.54E-04

0.87

0.30

1.99E-03

Chr6

157136501

157137000

−0.96

0.19

1.15E-06

−0.78

0.27

2.19E-03

0.91

0.30

1.37E-03

1.30

0.25

1.62E-07

Chr14

104067251

104067750

0.71

0.14

1.17E-06

0.81

0.21

7.35E-05

−0.75

0.22

3.89E-04

−0.58

0.24

9.44E-03

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Genome Medicine

ISSN: 1756-994X

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