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Table 3 Effect of ICSI on the FDR 25% WBC IVF-DMRs

From: DNA methylation changes at infertility genes in newborn twins conceived by in vitro fertilisation

    IVF (n = 40) versus non-IVF (n = 58) IVF (n = 34) versus non-IVF (n = 58) adjusted for ICSI Conventional IVF (n = 16) versus non-IVF (n = 58) ICSI (n = 18) versus non-IVF (n = 58)
Chromosome Start End Estimate SE P Estimate SE P Estimate SE P Estimate SE P
Chr2 217726751 217727250 1.18 0.19 2.30E-09 1.45 0.26 7.71E-08 −1.42 0.26 7.44E-08 −1.16 0.27 1.29E-05
Chr5 178761751 178762250 −1.08 0.2 5.43E-08 −1.09 0.29 8.23E-05 0.87 0.30 1.89E-03 1.11 0.27 2.52E-05
Chr9 97504001 97504500 1.07 0.2 5.83E-08 0.77 0.27 2.77E-03 −0.88 0.31 2.67E-03 −1.30 0.25 1.95E-07
Chr5 9275751 9276250 1.09 0.19 5.86E-08 1.17 0.27 1.04E-05 −1.13 0.29 6.50E-05 −1.13 0.27 2.75E-05
Chr4 184814001 184814500 −0.96 0.18 7.95E-08 −0.97 0.24 3.94E-05 0.94 0.26 1.37E-04 1.15 0.23 8.35E-07
Chr5 142488501 142489000 −1.11 0.2 8.73E-08 −1.1 0.28 7.60E-05 1.25 0.31 5.16E-05 1.08 0.28 7.10E-05
Chr9 118148751 118149250 1.09 0.2 9.20E-08 1.35 0.28 1.28E-06 −1.30 0.29 8.90E-06 −1.02 0.28 1.68E-04
Chr9 118149001 118149500 1.08 0.2 1.04E-07 1.31 0.28 2.22E-06 −1.23 0.29 2.00E-05 −1.05 0.29 1.69E-04
Chr11 82654251 82654750 −1.05 0.19 1.30E-07 −0.97 0.29 4.68E-04 0.95 0.31 1.53E-03 0.88 0.27 5.94E-04
Chr19 6165251 6165750 0.94 0.18 1.40E-07 0.89 0.25 1.90E-04 −0.88 0.28 9.35E-04 −1.02 0.23 7.36E-06
Chr1 85522251 85522750 0.99 0.18 1.43E-07 1.54 0.25 4.48E-09 −1.53 0.25 7.41E-09 −0.80 0.28 2.32E-03
Chr17 42569001 42569500 −1.07 0.19 1.64E-07 −1.25 0.27 2.21E-06 1.30 0.28 3.81E-06 1.21 0.26 2.44E-06
Chr4 141606501 141607000 1.09 0.19 2.03E-07 1.26 0.26 3.56E-06 −1.33 0.30 1.05E-05 −1.13 0.26 1.83E-05
Chr5 137736001 137736500 −1.03 0.19 2.06E-07 −1.11 0.28 4.12E-05 1.13 0.30 1.39E-04 1.10 0.27 3.78E-05
Chr5 150614501 150615000 −1.08 0.21 2.14E-07 −1.2 0.29 2.80E-05 1.24 0.31 3.18E-05 1.07 0.29 1.21E-04
Chr17 36918251 36918750 −1.1 0.21 2.32E-07 −0.96 0.29 6.01E-04 1.05 0.31 4.88E-04 1.03 0.28 1.83E-04
Chr6 126138251 126138750 −0.99 0.19 2.36E-07 −0.75 0.27 3.29E-03 0.79 0.30 4.92E-03 1.22 0.25 8.94E-07
Chr7 144431251 144431750 1.02 0.19 2.70E-07 0.84 0.28 1.30E-03 −0.85 0.28 1.48E-03 −1.17 0.27 1.77E-05
Chr12 70937251 70937750 0.88 0.17 2.76E-07 0.72 0.23 1.12E-03 −0.87 0.26 5.26E-04 −0.94 0.20 3.10E-06
Chr4 141606251 141606750 1.01 0.19 2.80E-07 1.16 0.26 8.05E-06 −1.31 0.29 6.93E-06 −1.04 0.25 2.14E-05
Chr13 90019001 90019500 1.06 0.2 2.84E-07 1.25 0.29 8.88E-06 −1.36 0.30 5.09E-06 −0.84 0.29 2.20E-03
Chr11 74179001 74179500 1.07 0.2 2.92E-07 1.3 0.29 7.25E-06 −1.37 0.29 3.15E-06 −1.06 0.29 1.76E-04
Chr12 99153001 99153500 −1.01 0.2 3.93E-07 −1.02 0.29 2.02E-04 1.02 0.31 4.59E-04 1.24 0.27 3.77E-06
Chr2 223336751 223337250 −1.01 0.2 4.47E-07 −1.41 0.28 4.00E-07 1.50 0.29 1.69E-07 0.77 0.29 4.65E-03
Chr8 120972001 120972500 0.97 0.19 4.98E-07 0.83 0.27 1.22E-03 −0.87 0.29 1.43E-03 −0.96 0.26 1.81E-04
Chr17 38047001 38047500 −1.04 0.2 5.25E-07 −1.3 0.28 4.51E-06 1.31 0.27 1.21E-06 0.74 0.28 5.39E-03
Chr4 64626751 64627250 −0.99 0.19 5.45E-07 −0.87 0.28 9.92E-04 0.86 0.29 1.61E-03 0.98 0.26 1.36E-04
Chr16 87256751 87257250 −0.83 0.16 5.51E-07 −0.97 0.23 1.75E-05 0.94 0.25 9.13E-05 0.82 0.24 3.37E-04
Chr19 10656751 10657250 −1.03 0.2 5.77E-07 −1.09 0.28 6.47E-05 1.17 0.29 3.80E-05 1.13 0.27 2.18E-05
Chr7 2487251 2487750 0.8 0.16 5.85E-07 0.73 0.23 1.06E-03 −0.81 0.24 5.61E-04 −0.94 0.23 3.49E-05
Chr11 74178751 74179250 0.99 0.2 6.82E-07 1.19 0.28 2.15E-05 −1.15 0.28 2.45E-05 −0.82 0.28 2.37E-03
Chr10 119176501 119177000 −1.04 0.2 6.87E-07 −1.03 0.29 3.41E-04 1.16 0.31 1.69E-04 1.14 0.28 4.83E-05
Chr22 34755251 34755750 −0.98 0.2 7.32E-07 −0.8 0.28 2.35E-03 0.97 0.31 1.21E-03 1.15 0.25 3.95E-06
Chr6 161664751 161665250 0.98 0.19 7.42E-07 0.9 0.26 3.89E-04 −0.83 0.29 2.48E-03 −0.81 0.25 7.71E-04
Chr16 17161751 17162250 −1.01 0.2 7.80E-07 −0.99 0.28 2.19E-04 1.17 0.30 4.48E-05 1.08 0.28 1.16E-04
Chr18 23695001 23695500 1.04 0.21 8.39E-07 0.95 0.29 5.83E-04 −1.04 0.32 6.05E-04 −1.11 0.28 3.96E-05
Chr9 26364751 26365250 −0.95 0.19 8.90E-07 −0.96 0.28 2.78E-04 1.13 0.30 9.90E-05 0.96 0.28 2.77E-04
Chr1 25227001 25227500 −0.83 0.17 9.05E-07 −0.87 0.25 3.81E-04 0.78 0.25 1.39E-03 0.99 0.25 5.78E-05
Chr13 68877251 68877750 0.97 0.2 9.43E-07 1.01 0.28 1.44E-04 −1.24 0.28 1.05E-05 −0.84 0.28 1.39E-03
Chr9 89126501 89127000 −0.92 0.19 9.59E-07 −1.14 0.26 9.49E-06 1.10 0.28 6.62E-05 0.76 0.26 2.12E-03
Chr13 35317501 35318000 −0.96 0.2 9.72E-07 −0.54 0.29 4.44E-02 0.54 0.31 6.52E-02 1.04 0.27 7.61E-05
Chr21 19575001 19575500 0.96 0.19 9.92E-07 0.88 0.27 8.63E-04 −0.96 0.30 8.25E-04 −1.13 0.26 1.24E-05
Chr2 169470001 169470500 −1.02 0.21 1.06E-06 −1.31 0.28 2.08E-06 1.33 0.29 6.99E-06 1.04 0.27 5.91E-05
Chr12 4310251 4310750 −0.99 0.2 1.06E-06 −0.91 0.29 8.79E-04 1.02 0.30 4.54E-04 0.87 0.30 1.99E-03
Chr6 157136501 157137000 −0.96 0.19 1.15E-06 −0.78 0.27 2.19E-03 0.91 0.30 1.37E-03 1.30 0.25 1.62E-07
Chr14 104067251 104067750 0.71 0.14 1.17E-06 0.81 0.21 7.35E-05 −0.75 0.22 3.89E-04 −0.58 0.24 9.44E-03